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    1. 尊龍凱時(shí)人生就博血液病基因檢測全外顯子測序?qū)嶒?yàn)步驟

        基因組學(xué)正正在推進(jìn)癌癥探索范圍的迅疾發(fā)達(dá),出格是癌癥診斷、歇養(yǎng)和監(jiān)控的式樣上。上期 給民眾先容了 突變 特性說明、腫瘤突變負(fù)荷說明(TMB)血液病基因檢測、雜合性缺失■說明(LOH),尊龍凱時(shí)人生就博個(gè)中TMB 和LOH都○是常睹的腫瘤標(biāo)識物的閉連▽說明手法,咱們只需對全外顯子測序(whol■e exome sequenc ing, WES○ )…數(shù)據(jù)舉辦TMB和LOH 說明就可認(rèn)為癌癥診斷和歇養(yǎng)供應(yīng)手法和思緒。下圖閃現(xiàn)了WES正在腫 瘤探索的 整個(gè)說明實(shí)質(zhì),原本同源重組缺陷說明(H=RD)、新抗原變異說明(HLA)的道理及使用還沒有先容全外★顯子測序試 驗(yàn)方法,下面我將分辯先容。

        同源重組(Homolo=g ous recom bination, HR)是一個(gè)高度守舊的歷程,正在 DNA修復(fù)、DNA 復(fù)制、減數(shù)松○…散染色體△闊別★和端 粒撐持中○起著 首要 用意。這個(gè)歷程不 光創(chuàng)作了遺傳眾樣性,還連■結(jié)了 DNA 序列的安定性。同源重 ■組也產(chǎn)生正在有絲松散中,它通過準(zhǔn)確修復(fù) DNA 雙鏈斷 裂和尋常細(xì)胞代謝歷程中碰到的其他毀傷來推進(jìn)DNA的安=定性??墒钱?dāng)DNA產(chǎn)生毀傷時(shí),若無法尋常通★過同源重組修復(fù)(HRR)通道來修復(fù)DNA毀傷就會產(chǎn)生同源重組缺陷(Homolog■ous r○ecombination deficiency,尊龍凱時(shí)人生就博 HRD)。普通來說,HR D可由HR■R閉連基因 胚 系突變或體細(xì)胞○突變 以及外觀遺■傳失活等諸眾成分導(dǎo)致。少許已知的編碼同源重組卵 白的基因有:BRCA1、BRCA2、ATM、ATR、BARD1、BLM、RAD51 等…血液病基■■因檢…測 <=/s t r○on g>。個(gè)中, 編碼同源重組卵白的BRAC1 和 BRCA 2 的體細(xì)胞突變由于涉及遺傳性乳腺癌和卵 巢癌< strong○>全外顯子測序試驗(yàn) 方○法,成為 HRD 中的熱門探索對★象。

        凡是情景下,細(xì)胞中?常睹的■DNA修復(fù)式 樣搜羅兩種,堿基 切除修復(fù)( ■…BER) 和HRR。當(dāng)細(xì)胞的DNA涌■?現(xiàn)=毀傷 時(shí),尋常 情景下細(xì)胞能夠抉擇兩種式樣中的一種舉辦DNA 修復(fù),使得該細(xì) 胞行使尋常性命舉動,是以只消有一條通道連結(jié)尋常的修復(fù) 效力,細(xì)胞就不會亡故。倘若咱們能通過外顯子測○序檢測 到腫瘤細(xì)胞中產(chǎn)生了HRR突變形態(tài),那分析同源重組修■復(fù)式樣曾 經(jīng)缺○陷,是以,倘若沒有藥物干擾,癌細(xì)胞會通過BER式樣 舉 辦自我 修復(fù)。但倘若○咱們應(yīng)用貶★抑劑阻斷BER通道,就會使得癌細(xì)胞的DNA修復(fù)無法通過兩種式樣的個(gè)中一種尋常修復(fù),從而使得 產(chǎn)生HR D形態(tài)的癌細(xì)胞合成致死,最終抵達(dá)腫瘤歇養(yǎng)的效率。目前○已被淵博使用的貶抑劑★有鉑類和PARP貶抑劑。

        綜上,通過△外 顯子測序檢 測 癌細(xì)胞○○的H○RD?…形態(tài)尊龍凱時(shí)人生就博血液病基因檢測全外顯子測序?qū)嶒?yàn)步驟,就能夠?qū)RD行動一種新的生物標(biāo)識物,正在腫○瘤的個(gè)人化△歇養(yǎng)中施○展強(qiáng)壯的用意,因?yàn)镠RD細(xì)胞對★PARP 貶抑劑的敏銳性,HRD 的檢測正在腫瘤患者的用藥領(lǐng)導(dǎo)及預(yù)后監(jiān)測中至 閉首要。

        正在HRD說明中,通過全外顯 子組測序來計(jì)劃HRD水準(zhǔn),評估基因擔(dān)心定性。用于確定 HR D □評分的 3 個(gè)成分分辯為:基因? 組雜合性缺失 (LOH)、端粒等位基因不均衡 (TAI) 和大片斷遷徙(L ST)。腫瘤體細(xì)胞中應(yīng)用sc arHRD軟件對HRR通道閉連基因的LOH、TAI、LST三個(gè)目標(biāo)舉辦打分,當(dāng)三=○個(gè)目○標(biāo)得分 總和≥…42,判別腫 瘤細(xì)胞的形態(tài)為HRD○陽性。

        比如 Roberto Moretto等人[1]探索了HRD○行動結(jié)直腸癌(CRC)的腫瘤標(biāo)識物的歇養(yǎng)效率,通過對 ?9321例=CRC腫瘤□患者舉辦WES說明,結(jié)果涌現(xiàn) ○?有?1270(13。6%)例是HRD陽性,其余為無○HRD○=?(即H…R○P○)。尊龍凱時(shí)人生就博MSI腫瘤中HRD腫瘤的產(chǎn)生率高于MSS腫瘤。正在TRIBE2探索中,MSS▽和HRD腫瘤患者的總▽生活期比MSS和HRP腫瘤患者長。以是HRD是MSS CRC腫瘤的一個(gè)特異標(biāo)。