物芯片的本領(lǐng)要領(lǐng), 采用相干明白的設(shè)施即全基因 組相干探求(Genome-wide○ association studies, GW…AS) 來篩選豐 富疾病易感基因, 得○到了空前絕后=的成 就。但因為 GWAS 存○正在著肯定的節(jié)制性, 同時跟著 新一代測序 本領(lǐng) 的■迅猛開展, 激動了全基因組○測序 和 全基因組外顯子 測序的開展。本文就全基因■組外 顯子測序的探 求設(shè)施及其行使作一綜述。 DNA 測序、生物音○信學統(tǒng)計 3 個要緊次序 全外顯子基因測序告訴何 如看。 2。1 目 的區(qū)域序列的富集…… 正在過去的 20 年里, 守舊的 Sanger 測序要緊是利 用 Uniplex PCR 和 Mutlip lex ▽PCR 設(shè)施富集目的區(qū)域 序列 [6], 但其引物合成與 PCR 反響所○需用 ○度都很 高, 且實習周期長、人力資源浪費大。而新一○代測序需 要對■巨○○額外 顯子舉 行測序, 進而探求疾 病聯(lián)系區(qū)?域 并 SNP 驗□證, 守舊的設(shè)=施不行滿意這一○央浼, 正在此 靠山下, Nimb l eG○ en 公司和 安捷倫接踵○拓荒了新的 …本領(lǐng)以治理 這一宏大題目,尊龍凱時 為全基因組外顯子測序 的遍及利用○供給了△平臺。 2。1。1 NimbleGen? 公司的外顯 子捉拿芯 片○ 羅氏 NimbleGen 推出的基于= HD2 平臺 2。1M… 外 顯子序列捉拿芯片[6]▽ (Sequence C apt ure 2。1M Human Exome microarr○ays)要緊是…愚弄雜交和 DNA 微陣列 本領(lǐng)基因區(qū)別道理來捉拿目的區(qū)域。其大致流程=是 將打斷后的○基因組 DNA 與定制的序列捉拿芯片雜 交, 洗去未雜交上的片斷, 隨后將富集▽的目的 片斷 洗脫擴增, 終末舉行高通量測序。該設(shè)施具有高特○ 異性和高遮蓋度全外顯子基因測序告訴何如看、捉拿區(qū)域可按需打算和△?省時省力 等便 宜 tional HapMap project)的告竣○以及高通量生物芯 片 本領(lǐng)的告捷研發(fā), 人們遍及愚弄高通量全基因組生。 雜合體, 洗脫磁珠,尊龍凱時 降解 RNA 誘餌, 富集宗旨區(qū)域, 再舉行高通量測序?;?液相=序列捉拿的高通量 平 ○行靶向測序本領(lǐng)具有高度特異性全外顯子 組基因檢?測 是□查什么的 △、高鑿鑿性、優(yōu)異 的重現(xiàn) 性和遍及 的 行使前景。 2。2 2。2。1 測序△本領(lǐng) 守舊的測序本領(lǐng) 最早○的 DNA 測序本領(lǐng)是 1977 年 San■ge△r ★的“雙 脫氧鏈結(jié)尾終止法”和 Maxa m 及 G□ilbe rt 的“化學降 解法”。 利 用最眾 的是▽▽ Sange○r 測序法, 但這種測序儀 平常一次最眾只□可同時舉行 96 個或 ○384 ■個樣品的測 序。Sanger 測 序本領(lǐng)原委 30 年的不竭開展與完竣, 現(xiàn)正在的測序長度可達 1 000 bp, 每一個堿○基的★讀取 鑿 鑿率高□達 99。999%, 用度大約為 0。5 美元/=1 000 個 堿 基, 已成為測?序的金 規(guī)范 [8]。 2。2。2 新一代測序本領(lǐng)(Next-generation sequ…encing) 守舊□的 Sanger 測序法無法大幅度的消浸測序費 用, 而基因變異