全外顯子測(cè)尊龍凱時(shí)序?qū)嶒?yàn)步驟全外顯子組測(cè)序廣博使用于性命科學(xué)及農(nóng)業(yè)科學(xué)商酌。微陣列芯片依據(jù)效力分類厲重有外達(dá)譜芯片全外顯子測(cè)序?qū)嵺`舉措、SNP分型芯片■及甲□基化芯片■等。微陣列芯片的典范代外是Affimatrix的“GeneChip”產(chǎn)物，也即是邦內(nèi)贊嘆的“基因芯片”或“SNP 芯片”。此類？

　　過去很長(zhǎng)一段功夫內(nèi)，邦內(nèi)的 S?…NP檢 ? 測(cè) 芯 □片厲重以□△這類 的“固態(tài)”芯片為主全外 顯子組測(cè)序，尊龍凱時(shí)人生就博正在畜牧、家禽、水產(chǎn) 及 作物 剖釋育種檢測(cè)中有著極端得勝的使用。但因?yàn)樾酒_墾本錢高、行使本錢上等題目，仍舊無△法饜▽ 足新□穎 作物育種 的低本錢的需 求。

　　圖2 Illumina iScan 行使芯片實(shí)行 基因型檢測(cè)（圖片來自匯集）！

　　靶向捕捉測(cè)序是跟著二代測(cè)序成熟后涌△現(xiàn)的一種低本錢高通量位點(diǎn)檢測(cè)技■能。這項(xiàng)技能早期最廣博的使用是正在醫(yī)學(xué)商酌中的全外顯子捕捉測(cè)序及遺傳疾病位點(diǎn)檢測(cè)中。正在邦際上全外顯子測(cè)序?qū)嵺`舉措，這項(xiàng)技能平時(shí)稱之為“Targ eted genotypin g by sequ e★ncing”或“Geno▽ typing bytargets equencin g”，邦內(nèi)平時(shí)稱之為“靶向捕捉測(cè)序”。正在醫(yī)學(xué) 根本■△商酌?和臨床檢★ 測(cè)篩查中！

　　近年來跟著本錢的降落，靶向捕捉測(cè)序技能漸漸從根本醫(yī)學(xué)及分子診斷界限擴(kuò)展到農(nóng)業(yè)育種界限。該技能正在農(nóng)業(yè)育種中最初被使用于育種選育本錢較高的動(dòng)物育種界限（比方畜牧、家禽、水產(chǎn)等），自后起先正在作○物育種與精○準(zhǔn)判 斷 中大范圍的使用。外洋育種企業(yè)行使液相○捕捉測(cè)序 實(shí)行高通量的基因型判斷輔助育種能夠追溯到10年前。邦內(nèi)的液相捕捉測(cè)序正在農(nóng)業(yè)▽中的使用是近來幾年才成長(zhǎng)起來，漸漸以低本=錢上風(fēng)代替固相 的SNP芯片檢測(cè)。

　　正在邦內(nèi)少許育種界限的△ 處事家每每行○使“液相芯片”如此的詞來實(shí)行靶向測(cè)序○處事先容。厲重因?yàn)檎諛由僭S公司為了觀念上的“革新”，尊龍凱時(shí)人生就博將液相捕捉技能包裝成“液相芯片”來擴(kuò)張。也許是近來幾年“芯片”這個(gè)詞太火了，什么=樣 的★○產(chǎn)物 都 生氣和芯片 扯?上□聯(lián) 系。動(dòng)作腳踏實(shí)地的科研處事家，正在 分子檢測(cè)▽界限應(yīng) 當(dāng)沒有□找到“液相芯片”這個(gè)產(chǎn)物的適應(yīng)英文詞組。就坊鑣前面的先容，邦際 上和■□邦內(nèi)根本醫(yī)學(xué)檢測(cè)界限這項(xiàng)技能真正○廣博行使并得回認(rèn)同的名稱是○▽靶向捕捉測(cè)序。

　　“ 液相 芯片 ”不是芯片，而是高密度的“核酸序列咸集”（仿…佛于= 高 密度引物序列），通過分子雜交的格式得 ?回特定區(qū)域 的序列訊息。固然靶向捕捉測(cè)序（“液相芯片”）不是芯片尊龍凱時(shí)，但其感化與守舊的固△ 相SNP芯片相通，都是被用○ 于實(shí)行高通□量符號(hào)檢測(cè)。

　　圖4 用于雜交捕捉實(shí)踐的帶妝點(diǎn)核酸存放于試管中(“探針/Probes”)！

　　方便來說，液相芯片實(shí)在即是一管“帶妝點(diǎn)的核酸咸集”，如上圖4。通過對(duì) DN○A?！霭濉?實(shí)行帶 =生物 ▽素 的擴(kuò)增，即可得回“液相捕捉探針”，和眾人★ 實(shí) 踐室 行 使的△引物池仿佛，兩者的區(qū)?別正在序列的長(zhǎng)度與序列是否帶有▽生物素妝點(diǎn)。正在舊例實(shí)踐中，咱們平時(shí)行使■的一對(duì)引物擴(kuò)增一段序列。正在靶向捕捉測(cè)序?qū)嵺`中尊○龍凱時(shí)，往往★是成千上萬差異○品種的序列，可能同 時(shí)與基因組差異區(qū)域?qū)嵭须s交。因?yàn)楹怂岷铣膳c擴(kuò)增本?錢極 端低，因而液相捕捉技能可能?供給極端低的檢測(cè)價(jià)★值。

　　須要出格提防的是，又有一種 早期廣博使用的高通量 基因分型技能△叫做“Genotyping by sequencing(GBS)” 或者”Restrictio▽n site-associ=a…ted DNA se○□quencing (RAD-Seq)“簡(jiǎn)化基因△組測(cè)序技能全外顯子測(cè)序?qū)嵺`舉措。這是一類操縱酶切得回基因組片斷并實(shí)行測(cè)序的技能 全外顯子組測(cè)序。因?yàn)榧寄艿览砻盖械牟还佑?strong>全外顯子組測(cè)序，導(dǎo)致這項(xiàng)技能位點(diǎn)檢測(cè)的反復(fù)○性差，并不△是一種固定位點(diǎn)檢測(cè)技能。