人全外顯子組序列捉拿中式二代測(cè)序 概述 外顯子組是指悉數(shù)外顯子區(qū)域的聚會(huì), 該區(qū)○域包蘊(yùn)合★成卵白質(zhì)所需 要的緊張★新聞,涵蓋了與▽ 個(gè)別外型干 系○的大?★部門(mén)成效性變異。外顯子組 序列捉 拿中式二代測(cè)序是一種新 型的基因組理解工夫: 外顯子?序列捉拿 芯片(或溶液)可正在統(tǒng)一張芯片上以高特 異性和高籠蓋率捉拿商量者感 趣味的對(duì) 象外顯子區(qū)域,后續(xù)運(yùn)用○ Solexa/SOLiD/Roche 454 測(cè)序直接 解析數(shù)據(jù)。 工夫途徑 以 Ni○mblegen 外顯子捉拿勾結(jié) ■Solexa 測(cè)序?yàn)槔右躁U明:基因組 DNA 起首被隨機(jī)打斷 成 500bp■ 旁邊的片斷,隨后正在 DN ★A 片斷兩▽頭分…□ 散相連上接頭。原委 PCR 庫(kù)檢及格后的 DN A○ 片斷與 ○N?imbleGen 2。1M Huma??n Exome ○Arr…a=y 芯片舉辦雜交。去除▽ =未與 芯△片勾結(jié)的后臺(tái) DNA 后, 將原委富集的外顯子區(qū) 域的 DNA 片斷洗脫下來(lái)外顯子捉拿測(cè)序的道理。 這些△ DNA 片 斷又隨機(jī)相連發(fā)展 DN?A 片斷。 與全基因組重測(cè)序比擬, 外顯子組測(cè)序只需○針對(duì)外顯★子區(qū)域的 DNA 即可,籠蓋度更深、數(shù)據(jù)鑿鑿 性更高外顯子 組測(cè)序試劑盒仿單 ?。?)對(duì)象外顯子區(qū)域 SNP 檢=測(cè)及正在 CCDS 數(shù)據(jù)庫(kù)中的○注解; (5)可變剪切、基因協(xié)調(diào)、外顯子協(xié)調(diào)理解 后,再次被隨機(jī) 打斷并 正在▽其兩□?頭加■上○ 測(cè) 序 接頭,原委 L▽M-P○CR 的線性擴(kuò)增,尊龍凱時(shí)正在經(jīng) qPCR 質(zhì)地檢 測(cè)及格后即可上機(jī) 測(cè)序。 生物新聞學(xué) 理解流程圖 商量實(shí)質(zhì) 1.外顯子組捉拿 與測(cè)序 將基因組 DNA 隨機(jī)打斷成片斷, 通過(guò)與人全外顯子捉拿芯片雜交富 集…外顯子區(qū)域, 通過(guò)第二 代測(cè) 序 工夫?qū)ψ?○拿 的序列□舉辦測(cè)序。 2.基礎(chǔ)數(shù)據(jù)理解 數(shù)據(jù)產(chǎn)出○統(tǒng) 計(jì):對(duì)測(cè)序結(jié)果舉辦圖像識(shí)別(Base calling),去除污染及接頭序列;統(tǒng)計(jì)結(jié) 果網(wǎng)羅:測(cè)定的 序列(Rea?ds)長(zhǎng)度
全外顯子組 測(cè)序工=夫
,愈加簡(jiǎn)潔、高效??捎糜凇?尋找△龐 大 疾○○病?=?( 如:癌癥、糖尿病、肥胖癥等)的致病基因和易感 基 因 等的商量